Dispositif collectif RECORD

Le dispositif collectif RECORD a pour mission de mobiliser des outils informatiques et mathématiques dans le cadre de la modélisation et la simulation d’agroécosystèmes et de systèmes écologiques. L’objectif est d’accompagner les modélisateurs agronomes et écologues dans la mise en œuvre de solutions pour l’informatisation et la simulation de leurs modèles. Les actions proposées par le dispositif sont les suivantes :

  1. Accompagner au développement et à la maintenance de simulateurs
  • Mise en œuvre de langages de programmation tels que C++, R, Python, fortran et mobilisation de suites logicielles dédiées à la modélisation et la simulation telles que VLE.

  • Amélioration des performances des simulateurs (par exemple à travers l’utilisation de Rcpp pour les codes R ou pybind11 pour les codes python).

  1. Déployer des applications autour des simulateurs
  • Empaquetage de simulateurs et d’outils logiciels pour la simulation (empaquetage conda et R, conteneurisation docker, Singularity)

  • Mise à disposition de simulateurs à travers l’internet selon des approches SaaS, sous forme de chaînes de traitement de type Galaxy, de services web (API REST), d’applications web (de type RShiny pour la visualisation…).

  1. Mobiliser des ressources de calcul intensif pour la simulation
  • Mise en œuvre de chaînes de traitements de type Galaxy sur des grappes de serveur de calcul (en particulier MESO@LR)

  • Accompagnement à l’utilisation de ressources pour le calcul haute performance (utilisation d’un ordonnanceur Slurm, …)

  1. Accompagner à l’utilisation de méthodes d’exploration de modèles numériques
  • Mobilisation de méthodes formelles d’analyse et de calibration de modèles.

Au quotidien, les agents du dispositif mobilisent des outils facilitant le développement collaboratif et la diffusion de leur travail (utilisation intensive de forges) ainsi que la qualité et la reproductibilité de la production (versionnement, conteneurisation, intégration et livraison continues, infrastructure as code …).


Le dispositif collectif RECORD est constitué d’une équipe d’ingénieurs en informatique et en calcul scientifique du département MathNum. Les membres de l’équipe ont également des responsabilités dans divers réseaux et projets connexes aux activités du dispositif collectif:

Posted at — Nov 23, 2021